北京大学医学部把所属的“转化医学中心”，“北京大学药学院”，“北京大学医学部质谱中心”，“国家卫计委生殖医学中心”和“北大医学部-方正创新药物研发基金”落户健康产业园。通过辅助医药创新企业发展——北大医学部与北大医疗产业园建立转化医学研究、新药发现、中试、临床研究、制造、销售的“产学研”共享模式，快速高效的推动创新药物研发，增强首批试点项目平台的社会服务能力；联合申报项目——北大医学部与北大医疗产业园围绕创新药物的发现与转化、转化医学研究、口腔数字化医疗技术和材料等领域开展合作研究，联合申报国家级重点（工程）实验室和重大科研项目，联合开展若干研发项目，联合建设创新药孵化基地等进行合作。
北大医学部与北大医疗产业园依照国家和学校的相关法律法规，联合培养高层次、复合型、应用型人才，同时北大医学部在北大医疗产业园内合作项目中产生的科研成果，在同等条件下，优先提供给园区进行转化。